Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX1P48742 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX1P48742 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX1P48742 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX1P48742 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LHX1P48742 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX1P48742 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX1P48742 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX1P48742 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX1P48742 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LHX1P48742 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX1P48742 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX1P48742 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX1P48742 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX1P48742 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX1P48742 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX1P48742 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LHX1P48742 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LHX1P48742 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX1P48742 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX1P48742 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX1P48742 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX1P48742 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX1P48742 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX1P48742 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX1P48742 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX1P48742 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX1P48742 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX1P48742 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX1P48742 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX1P48742 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX1P48742 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX1P48742 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX1P48742 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX1P48742 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX1P48742 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX1P48742 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX1P48742 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX1P48742 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX1P48742 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX1P48742 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX1P48742 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX1P48742 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX1P48742 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX1P48742 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX1P48742 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX1P48742 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX1P48742 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LHX1P48742 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX1P48742 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX1P48742 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX1P48742 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX1P48742 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX1P48742 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX1P48742 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX1P48742 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX1P48742 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX1P48742 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX1P48742 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX1P48742 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX1P48742 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX1P48742 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX1P48742 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX1P48742 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX1P48742 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX1P48742 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX1P48742 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX1P48742 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LHX1P48742 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms