Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PITPNBP48739 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PITPNBP48739 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms