Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA4P43694 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA4P43694 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GATA4P43694 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA4P43694 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA4P43694 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA4P43694 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA4P43694 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GATA4P43694 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GATA4P43694 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GATA4P43694 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA4P43694 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA4P43694 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA4P43694 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA4P43694 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA4P43694 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA4P43694 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA4P43694 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA4P43694 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA4P43694 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA4P43694 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA4P43694 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA4P43694 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA4P43694 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA4P43694 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA4P43694 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA4P43694 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA4P43694 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA4P43694 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA4P43694 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA4P43694 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA4P43694 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA4P43694 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA4P43694 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA4P43694 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA4P43694 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA4P43694 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA4P43694 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA4P43694 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA4P43694 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA4P43694 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms