Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD52P43351 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD52P43351 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD52P43351 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD52P43351 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD52P43351 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD52P43351 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD52P43351 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD52P43351 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD52P43351 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD52P43351 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD52P43351 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD52P43351 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD52P43351 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD52P43351 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD52P43351 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD52P43351 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD52P43351 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD52P43351 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD52P43351 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD52P43351 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD52P43351 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD52P43351 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD52P43351 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD52P43351 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD52P43351 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD52P43351 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD52P43351 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD52P43351 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD52P43351 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD52P43351 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD52P43351 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms