Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF5P43026 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF5P43026 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF5P43026 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF5P43026 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF5P43026 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF5P43026 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF5P43026 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF5P43026 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF5P43026 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF5P43026 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF5P43026 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF5P43026 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF5P43026 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF5P43026 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF5P43026 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF5P43026 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF5P43026 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF5P43026 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF5P43026 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF5P43026 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF5P43026 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF5P43026 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF5P43026 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF5P43026 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF5P43026 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF5P43026 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF5P43026 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF5P43026 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF5P43026 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF5P43026 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF5P43026 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF5P43026 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF5P43026 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF5P43026 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF5P43026 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF5P43026 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF5P43026 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF5P43026 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF5P43026 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF5P43026 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF5P43026 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF5P43026 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF5P43026 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF5P43026 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF5P43026 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms