Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC1P41238 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC1P41238 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms