Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM5CP41229 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5CP41229 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM5CP41229 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5CP41229 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms