Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC5P40937 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC5P40937 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFC5P40937 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFC5P40937 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC5P40937 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC5P40937 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC5P40937 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC5P40937 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RFC5P40937 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFC5P40937 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFC5P40937 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFC5P40937 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFC5P40937 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFC5P40937 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RFC5P40937 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFC5P40937 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFC5P40937 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFC5P40937 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFC5P40937 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFC5P40937 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFC5P40937 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFC5P40937 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFC5P40937 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFC5P40937 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFC5P40937 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RFC5P40937 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFC5P40937 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFC5P40937 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFC5P40937 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFC5P40937 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFC5P40937 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFC5P40937 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFC5P40937 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFC5P40937 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFC5P40937 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFC5P40937 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFC5P40937 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RFC5P40937 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFC5P40937 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFC5P40937 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFC5P40937 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFC5P40937 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFC5P40937 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFC5P40937 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFC5P40937 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFC5P40937 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFC5P40937 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFC5P40937 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RFC5P40937 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFC5P40937 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFC5P40937 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFC5P40937 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFC5P40937 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFC5P40937 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFC5P40937 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFC5P40937 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RFC5P40937 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFC5P40937 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms