Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAP2P40123 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAP2P40123 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP2P40123 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP2P40123 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP2P40123 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP2P40123 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP2P40123 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP2P40123 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP2P40123 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP2P40123 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP2P40123 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP2P40123 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP2P40123 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP2P40123 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP2P40123 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP2P40123 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP2P40123 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP2P40123 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP2P40123 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP2P40123 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP2P40123 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP2P40123 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP2P40123 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP2P40123 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAP2P40123 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAP2P40123 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAP2P40123 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAP2P40123 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAP2P40123 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAP2P40123 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP2P40123 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP2P40123 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP2P40123 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP2P40123 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP2P40123 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP2P40123 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAP2P40123 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAP2P40123 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAP2P40123 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAP2P40123 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAP2P40123 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAP2P40123 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP2P40123 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP2P40123 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP2P40123 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP2P40123 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAP2P40123 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP2P40123 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP2P40123 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP2P40123 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP2P40123 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP2P40123 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP2P40123 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP2P40123 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP2P40123 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP2P40123 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP2P40123 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP2P40123 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP2P40123 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAP2P40123 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAP2P40123 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAP2P40123 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP2P40123 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP2P40123 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP2P40123 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP2P40123 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP2P40123 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP2P40123 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms