Protein–RNA interactions for Protein: P39928

SLN1, Osmosensing histidine protein kinase SLN1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLN1P39928 STB5YHR178W 2232 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 UBC5YDR059C 447 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 VPS61YDR136C 573 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 EDC1YGL222C 528 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 SCEIQ0160 708 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 NDL1YLR254C 570 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YMR144WYMR144W 1029 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 TAE1YBR261C 699 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 GUT1YHL032C 2130 nt7.58□□□□□ -1.2
SLN1P39928 UIP5YKR044W 1332 nt7.57□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YDR029WYDR029W 315 nt7.57□□□□□ -1.2
SLN1P39928 CTF19YPL018W 1110 nt7.57□□□□□ -1.2
SLN1P39928 CCT8YJL008C 1707 nt7.57□□□□□ -1.2
SLN1P39928 RRP9YPR137W 1722 nt7.57□□□□□ -1.2
SLN1P39928 KEL1YHR158C 3495 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 ERV29YGR284C 933 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 ATG36YJL185C 882 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 FIP1YJR093C 984 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 SDS22YKL193C 1017 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YLR463CYLR463C 552 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 END3YNL084C 1050 nt7.56□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YDR541CYDR541C 1035 nt7.55□□□□□ -1.2
SLN1P39928 VMA3YEL027W 483 nt7.55□□□□□ -1.2
SLN1P39928 BI2Q0110 1272 nt7.55□□□□□ -1.2
SLN1P39928 TDH2YJR009C 999 nt7.55□□□□□ -1.2
SLN1P39928 RFC4YOL094C 972 nt7.55□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.55□□□□□ -1.2
SLN1P39928 VHS2YIL135C 1311 nt7.54□□□□□ -1.2
SLN1P39928 SGE1YPR198W 1632 nt7.54□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YOL150CYOL150C 312 nt7.54□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YIL055CYIL055C 1884 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 ZWF1YNL241C 1518 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 PGM1YKL127W 1713 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 VAC17YCL063W 1272 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 RPC53YDL150W 1269 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 CCE1YKL011C 1062 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YML018CYML018C 1182 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 MRPL24YMR193W 777 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 SSP2YOR242C 1116 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 EFT2YDR385W 2529 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 EFT1YOR133W 2529 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 LAG2YOL025W 1983 nt7.53□□□□□ -1.2
SLN1P39928 YDL121CYDL121C 450 nt7.52□□□□□ -1.21
SLN1P39928 FAL1YDR021W 1200 nt7.52□□□□□ -1.21
SLN1P39928 COA1YIL157C 594 nt7.52□□□□□ -1.21
SLN1P39928 ICT1YLR099C 1185 nt7.52□□□□□ -1.21
SLN1P39928 ARL3YPL051W 597 nt7.52□□□□□ -1.21
SLN1P39928 NTE1YML059C 5040 nt7.52□□□□□ -1.21
SLN1P39928 CYC8YBR112C 2901 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 FET4YMR319C 1659 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 ACS1YAL054C 2142 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YLH47YPR125W 1365 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 MSP1YGR028W 1089 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 LYS1YIR034C 1122 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 TAP42YMR028W 1101 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 SCS7YMR272C 1155 nt7.51□□□□□ -1.21
SLN1P39928 COX9YDL067C 180 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 ERJ5YFR041C 888 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 SEC28YIL076W 891 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 SAW1YAL027W 786 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 EFM3YJR129C 1020 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 OAC1YKL120W 975 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 TVP38YKR088C 1014 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YLR118CYLR118C 684 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YMR181CYMR181C 465 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 SLZ1YNL196C 897 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 MSO1YNR049C 633 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YPL257WYPL257W 582 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YPR027CYPR027C 834 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 SGF29YCL010C 780 nt7.5□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YDR514CYDR514C 1452 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 ESC2YDR363W 1371 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 COS6YGR295C 1146 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YIR042CYIR042C 711 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 AIM24YJR080C 1185 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YJR146WYJR146W 354 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 CDA2YLR308W 939 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 GFD1YMR255W 567 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 BSC4YNL269W 396 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 COQ3YOL096C 939 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 RKI1YOR095C 777 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 RPN8YOR261C 1017 nt7.49□□□□□ -1.21
SLN1P39928 MRC1YCL061C 3291 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 MED2YDL005C 1296 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YAP6YDR259C 1152 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 RPN9YDR427W 1182 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YER138W-AYER138W-A 105 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YFR045WYFR045W 930 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 POP5YAL033W 522 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 ADD66YKL206C 804 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 KSH1YNL024C-A 219 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 COG5YNL051W 1212 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 RUF23RUF23 254 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 PRP2YNR011C 2631 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 NPL6YMR091C 1308 nt7.48□□□□□ -1.21
SLN1P39928 YDR220CYDR220C 294 nt7.47□□□□□ -1.21
SLN1P39928 DMA1YHR115C 1251 nt7.47□□□□□ -1.21
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