Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FEN1P39748 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FEN1P39748 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FEN1P39748 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FEN1P39748 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FEN1P39748 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FEN1P39748 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FEN1P39748 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FEN1P39748 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FEN1P39748 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FEN1P39748 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FEN1P39748 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FEN1P39748 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FEN1P39748 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FEN1P39748 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FEN1P39748 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FEN1P39748 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FEN1P39748 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FEN1P39748 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FEN1P39748 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FEN1P39748 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FEN1P39748 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FEN1P39748 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FEN1P39748 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEN1P39748 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEN1P39748 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEN1P39748 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEN1P39748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEN1P39748 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FEN1P39748 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FEN1P39748 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEN1P39748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEN1P39748 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEN1P39748 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEN1P39748 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEN1P39748 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FEN1P39748 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEN1P39748 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEN1P39748 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEN1P39748 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEN1P39748 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEN1P39748 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FEN1P39748 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEN1P39748 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEN1P39748 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEN1P39748 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEN1P39748 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FEN1P39748 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FEN1P39748 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEN1P39748 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FEN1P39748 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FEN1P39748 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FEN1P39748 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FEN1P39748 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FEN1P39748 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms