Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP1P32455 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBP1P32455 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP1P32455 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP1P32455 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBP1P32455 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP1P32455 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP1P32455 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GBP1P32455 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP1P32455 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP1P32455 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP1P32455 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP1P32455 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP1P32455 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP1P32455 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP1P32455 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP1P32455 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP1P32455 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP1P32455 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP1P32455 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP1P32455 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP1P32455 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP1P32455 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP1P32455 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP1P32455 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP1P32455 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP1P32455 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP1P32455 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP1P32455 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP1P32455 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP1P32455 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP1P32455 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP1P32455 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP1P32455 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP1P32455 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP1P32455 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP1P32455 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP1P32455 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP1P32455 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP1P32455 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP1P32455 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP1P32455 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP1P32455 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP1P32455 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP1P32455 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP1P32455 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP1P32455 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP1P32455 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP1P32455 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP1P32455 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP1P32455 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP1P32455 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP1P32455 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP1P32455 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP1P32455 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP1P32455 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP1P32455 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP1P32455 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP1P32455 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP1P32455 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms