Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A1P32418 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A1P32418 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms