Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN2P32314 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXN2P32314 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXN2P32314 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXN2P32314 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms