Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3AP31941 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC3AP31941 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3AP31941 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms