Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA11P31270 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HOXA11P31270 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms