Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGA1P29973 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGA1P29973 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGA1P29973 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA1P29973 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms