Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMLP29590 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMLP29590 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMLP29590 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMLP29590 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PMLP29590 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PMLP29590 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMLP29590 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMLP29590 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMLP29590 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMLP29590 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMLP29590 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMLP29590 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMLP29590 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMLP29590 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMLP29590 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PMLP29590 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMLP29590 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMLP29590 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMLP29590 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMLP29590 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMLP29590 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PMLP29590 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMLP29590 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMLP29590 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMLP29590 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMLP29590 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMLP29590 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMLP29590 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMLP29590 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMLP29590 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMLP29590 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMLP29590 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMLP29590 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMLP29590 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMLP29590 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMLP29590 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMLP29590 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMLP29590 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMLP29590 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMLP29590 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms