Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBMS1P29558 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBMS1P29558 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBMS1P29558 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBMS1P29558 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.9 ms