Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LTKP29376 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LTKP29376 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
LTKP29376 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LTKP29376 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LTKP29376 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LTKP29376 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTKP29376 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTKP29376 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTKP29376 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTKP29376 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTKP29376 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTKP29376 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTKP29376 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LTKP29376 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LTKP29376 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LTKP29376 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LTKP29376 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LTKP29376 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTKP29376 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTKP29376 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTKP29376 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LTKP29376 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LTKP29376 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LTKP29376 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LTKP29376 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LTKP29376 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LTKP29376 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LTKP29376 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LTKP29376 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LTKP29376 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LTKP29376 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LTKP29376 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LTKP29376 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LTKP29376 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LTKP29376 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LTKP29376 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
LTKP29376 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
LTKP29376 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
LTKP29376 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LTKP29376 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LTKP29376 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LTKP29376 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LTKP29376 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTKP29376 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTKP29376 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTKP29376 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTKP29376 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LTKP29376 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LTKP29376 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTKP29376 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTKP29376 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTKP29376 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTKP29376 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTKP29376 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTKP29376 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTKP29376 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LTKP29376 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTKP29376 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LTKP29376 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LTKP29376 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LTKP29376 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
LTKP29376 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTKP29376 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTKP29376 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTKP29376 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTKP29376 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTKP29376 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTKP29376 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTKP29376 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LTKP29376 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
LTKP29376 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LTKP29376 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LTKP29376 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTKP29376 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTKP29376 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTKP29376 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTKP29376 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTKP29376 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTKP29376 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTKP29376 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTKP29376 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTKP29376 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTKP29376 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTKP29376 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTKP29376 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms