Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRR2P28476 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GABRR2P28476 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRR2P28476 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms