Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCD3P28288 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCD3P28288 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms