Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4AP27815 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4AP27815 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4AP27815 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4AP27815 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4AP27815 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE4AP27815 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4AP27815 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4AP27815 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4AP27815 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms