Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA3P26006 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA3P26006 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms