Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNE1P24864 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNE1P24864 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms