Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B4P23634 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B4P23634 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B4P23634 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms