Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGFR3P22607 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FGFR3P22607 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGFR3P22607 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms