Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BGNP21810 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BGNP21810 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BGNP21810 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BGNP21810 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BGNP21810 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BGNP21810 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BGNP21810 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BGNP21810 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BGNP21810 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BGNP21810 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BGNP21810 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BGNP21810 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BGNP21810 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BGNP21810 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BGNP21810 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BGNP21810 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BGNP21810 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BGNP21810 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BGNP21810 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BGNP21810 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BGNP21810 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BGNP21810 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BGNP21810 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BGNP21810 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BGNP21810 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BGNP21810 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BGNP21810 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BGNP21810 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BGNP21810 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BGNP21810 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BGNP21810 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BGNP21810 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms