Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6AP20340 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6AP20340 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB6AP20340 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms