Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGCP20142 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGCP20142 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGCP20142 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGCP20142 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGCP20142 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGCP20142 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGCP20142 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGCP20142 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGCP20142 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGCP20142 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PGCP20142 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGCP20142 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGCP20142 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGCP20142 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PGCP20142 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGCP20142 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGCP20142 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGCP20142 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGCP20142 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGCP20142 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGCP20142 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGCP20142 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGCP20142 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGCP20142 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGCP20142 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGCP20142 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGCP20142 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGCP20142 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGCP20142 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGCP20142 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGCP20142 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGCP20142 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGCP20142 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGCP20142 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGCP20142 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGCP20142 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGCP20142 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGCP20142 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGCP20142 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGCP20142 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGCP20142 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGCP20142 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGCP20142 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGCP20142 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGCP20142 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGCP20142 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGCP20142 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGCP20142 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGCP20142 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PGCP20142 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGCP20142 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGCP20142 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGCP20142 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGCP20142 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGCP20142 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGCP20142 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGCP20142 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGCP20142 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGCP20142 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms