Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN8P19075 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN8P19075 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN8P19075 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms