Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCLP18206 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCLP18206 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCLP18206 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCLP18206 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VCLP18206 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCLP18206 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCLP18206 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCLP18206 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCLP18206 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCLP18206 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCLP18206 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VCLP18206 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCLP18206 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCLP18206 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCLP18206 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCLP18206 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCLP18206 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCLP18206 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCLP18206 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VCLP18206 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCLP18206 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCLP18206 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCLP18206 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VCLP18206 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCLP18206 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCLP18206 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCLP18206 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCLP18206 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCLP18206 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VCLP18206 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCLP18206 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCLP18206 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCLP18206 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCLP18206 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VCLP18206 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCLP18206 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VCLP18206 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCLP18206 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCLP18206 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCLP18206 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCLP18206 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCLP18206 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCLP18206 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCLP18206 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCLP18206 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCLP18206 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCLP18206 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCLP18206 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCLP18206 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCLP18206 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCLP18206 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms