Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC2P18074 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC2P18074 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC2P18074 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms