Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFKLP17858 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFKLP17858 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFKLP17858 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFKLP17858 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFKLP17858 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFKLP17858 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFKLP17858 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKLP17858 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKLP17858 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFKLP17858 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKLP17858 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKLP17858 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKLP17858 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKLP17858 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFKLP17858 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFKLP17858 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFKLP17858 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFKLP17858 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKLP17858 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKLP17858 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKLP17858 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKLP17858 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKLP17858 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKLP17858 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFKLP17858 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKLP17858 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKLP17858 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKLP17858 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFKLP17858 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFKLP17858 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKLP17858 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKLP17858 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFKLP17858 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFKLP17858 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFKLP17858 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKLP17858 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKLP17858 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKLP17858 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKLP17858 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFKLP17858 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKLP17858 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKLP17858 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKLP17858 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKLP17858 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFKLP17858 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKLP17858 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKLP17858 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKLP17858 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKLP17858 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKLP17858 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFKLP17858 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFKLP17858 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFKLP17858 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKLP17858 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKLP17858 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKLP17858 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFKLP17858 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms