Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYN1P17600 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYN1P17600 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYN1P17600 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYN1P17600 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYN1P17600 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYN1P17600 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYN1P17600 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYN1P17600 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYN1P17600 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYN1P17600 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYN1P17600 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYN1P17600 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYN1P17600 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYN1P17600 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYN1P17600 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYN1P17600 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYN1P17600 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYN1P17600 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYN1P17600 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYN1P17600 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYN1P17600 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYN1P17600 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYN1P17600 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYN1P17600 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYN1P17600 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYN1P17600 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYN1P17600 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYN1P17600 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYN1P17600 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYN1P17600 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYN1P17600 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYN1P17600 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYN1P17600 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYN1P17600 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYN1P17600 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYN1P17600 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYN1P17600 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYN1P17600 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYN1P17600 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYN1P17600 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYN1P17600 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYN1P17600 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SYN1P17600 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYN1P17600 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYN1P17600 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYN1P17600 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYN1P17600 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYN1P17600 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYN1P17600 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYN1P17600 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYN1P17600 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYN1P17600 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYN1P17600 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYN1P17600 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYN1P17600 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYN1P17600 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYN1P17600 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYN1P17600 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYN1P17600 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYN1P17600 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYN1P17600 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYN1P17600 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYN1P17600 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYN1P17600 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYN1P17600 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYN1P17600 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYN1P17600 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYN1P17600 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYN1P17600 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYN1P17600 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYN1P17600 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYN1P17600 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYN1P17600 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYN1P17600 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms