Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2AFXP16104 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2AFXP16104 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms