Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSPP15924 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSPP15924 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSPP15924 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSPP15924 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSPP15924 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSPP15924 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DSPP15924 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSPP15924 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSPP15924 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSPP15924 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSPP15924 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSPP15924 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSPP15924 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSPP15924 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSPP15924 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSPP15924 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
DSPP15924 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSPP15924 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSPP15924 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSPP15924 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSPP15924 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSPP15924 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSPP15924 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSPP15924 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSPP15924 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DSPP15924 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSPP15924 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSPP15924 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DSPP15924 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSPP15924 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSPP15924 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSPP15924 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSPP15924 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSPP15924 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSPP15924 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSPP15924 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSPP15924 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSPP15924 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSPP15924 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSPP15924 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSPP15924 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSPP15924 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSPP15924 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSPP15924 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms