Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VEGFAP15692 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VEGFAP15692 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VEGFAP15692 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms