Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CPA1P15085 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPA1P15085 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPA1P15085 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CPA1P15085 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPA1P15085 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPA1P15085 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CPA1P15085 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPA1P15085 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPA1P15085 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPA1P15085 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPA1P15085 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPA1P15085 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPA1P15085 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CPA1P15085 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPA1P15085 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPA1P15085 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CPA1P15085 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPA1P15085 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPA1P15085 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPA1P15085 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPA1P15085 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CPA1P15085 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPA1P15085 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPA1P15085 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPA1P15085 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPA1P15085 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPA1P15085 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPA1P15085 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CPA1P15085 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPA1P15085 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPA1P15085 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPA1P15085 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CPA1P15085 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA1P15085 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA1P15085 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA1P15085 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA1P15085 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA1P15085 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA1P15085 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPA1P15085 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPA1P15085 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA1P15085 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA1P15085 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPA1P15085 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CPA1P15085 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CPA1P15085 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPA1P15085 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPA1P15085 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPA1P15085 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPA1P15085 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPA1P15085 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA1P15085 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA1P15085 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA1P15085 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA1P15085 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA1P15085 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA1P15085 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPA1P15085 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA1P15085 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA1P15085 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA1P15085 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA1P15085 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPA1P15085 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA1P15085 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPA1P15085 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA1P15085 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA1P15085 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA1P15085 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA1P15085 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPA1P15085 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms