Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA1P14867 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRA1P14867 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms