Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VDRP11473 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VDRP11473 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VDRP11473 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VDRP11473 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VDRP11473 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VDRP11473 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VDRP11473 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VDRP11473 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VDRP11473 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VDRP11473 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VDRP11473 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VDRP11473 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VDRP11473 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VDRP11473 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VDRP11473 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VDRP11473 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VDRP11473 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VDRP11473 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VDRP11473 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VDRP11473 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VDRP11473 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VDRP11473 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VDRP11473 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VDRP11473 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VDRP11473 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VDRP11473 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VDRP11473 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VDRP11473 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VDRP11473 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VDRP11473 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VDRP11473 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VDRP11473 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VDRP11473 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VDRP11473 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VDRP11473 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VDRP11473 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VDRP11473 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VDRP11473 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VDRP11473 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VDRP11473 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VDRP11473 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VDRP11473 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VDRP11473 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VDRP11473 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VDRP11473 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VDRP11473 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VDRP11473 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VDRP11473 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VDRP11473 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VDRP11473 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VDRP11473 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VDRP11473 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VDRP11473 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VDRP11473 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VDRP11473 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VDRP11473 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VDRP11473 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VDRP11473 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VDRP11473 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VDRP11473 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VDRP11473 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VDRP11473 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms