Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF1P10914 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF1P10914 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF1P10914 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF1P10914 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF1P10914 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF1P10914 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF1P10914 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF1P10914 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF1P10914 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF1P10914 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF1P10914 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF1P10914 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF1P10914 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF1P10914 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF1P10914 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF1P10914 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF1P10914 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF1P10914 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF1P10914 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF1P10914 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF1P10914 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF1P10914 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF1P10914 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF1P10914 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF1P10914 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF1P10914 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF1P10914 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF1P10914 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF1P10914 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF1P10914 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF1P10914 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF1P10914 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF1P10914 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF1P10914 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF1P10914 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF1P10914 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF1P10914 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF1P10914 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF1P10914 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF1P10914 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF1P10914 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF1P10914 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF1P10914 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF1P10914 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF1P10914 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF1P10914 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF1P10914 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF1P10914 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF1P10914 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF1P10914 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF1P10914 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF1P10914 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF1P10914 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF1P10914 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF1P10914 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF1P10914 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms