Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFB3P10600 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TGFB3P10600 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGFB3P10600 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms