Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARAFP10398 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARAFP10398 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARAFP10398 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARAFP10398 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARAFP10398 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARAFP10398 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARAFP10398 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARAFP10398 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARAFP10398 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARAFP10398 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARAFP10398 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARAFP10398 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARAFP10398 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARAFP10398 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARAFP10398 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARAFP10398 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARAFP10398 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARAFP10398 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARAFP10398 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARAFP10398 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARAFP10398 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARAFP10398 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARAFP10398 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARAFP10398 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARAFP10398 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARAFP10398 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARAFP10398 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARAFP10398 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARAFP10398 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARAFP10398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARAFP10398 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARAFP10398 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARAFP10398 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARAFP10398 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARAFP10398 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARAFP10398 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARAFP10398 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARAFP10398 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARAFP10398 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARAFP10398 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARAFP10398 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARAFP10398 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARAFP10398 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARAFP10398 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARAFP10398 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARAFP10398 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARAFP10398 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARAFP10398 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARAFP10398 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARAFP10398 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARAFP10398 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARAFP10398 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARAFP10398 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 818.1 ms