Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC192P0DO97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC192P0DO97 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms