Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P0DMU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P0DMU3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P0DMU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
P0DMU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P0DMU3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
P0DMU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P0DMU3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P0DMU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P0DMU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P0DMU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P0DMU3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P0DMU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P0DMU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P0DMU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P0DMU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P0DMU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P0DMU3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P0DMU3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P0DMU3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P0DMU3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P0DMU3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P0DMU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P0DMU3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P0DMU3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P0DMU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P0DMU3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P0DMU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P0DMU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P0DMU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms