Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
RGPD1P0DJD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RGPD1P0DJD0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms