Protein–RNA interactions for Protein: P0C880

Putative uncharacterized protein FLJ40606, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C880 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P0C880 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P0C880 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P0C880 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P0C880 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P0C880 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P0C880 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P0C880 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P0C880 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P0C880 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P0C880 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P0C880 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P0C880 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms