Protein–RNA interactions for Protein: P0C7U9

FAM87A, Protein FAM87A, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM87AP0C7U9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM87AP0C7U9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM87AP0C7U9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM87AP0C7U9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms