Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TFPTP0C1Z6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TFPTP0C1Z6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFPTP0C1Z6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms